Iako je Bokeljska mornarica u očima javnosti danas uglavnom prepoznata po svojoj manifestacionoj djelatnosti – nastupima na gradskim svečanostima i igranju tradicionalnog kola, ne treba izgubiti iz vida da je ona uvijek posvećivala veliku pažnju proučavanju pomorske istorije Boke Kotorske i kulturnom razvoju svog matičnog grada, uključujući, naravno, i proučavanje sopstvenog razvojnog puta. To je našlo izraza u njenoj aktivnoj saradnja sa drugim kulturnim institicijama, kao i u organizovanju odgovarajućih izložbi i naučnih skupova.
Iz takve djelatnosti Mornarice proizašla su kapitalna djela vezana za njenu istoriju, ali i za druge segmente kulturnog života Kotora, koja su publikovana u okviru njene vlastite izdavačke djelatnosti, nažalost često u vrlo ograničenim tiražima zbog nedovoljnih finansijskih sredstava. Ovdje navodimo ona najvažnija: